На страницу второго семестра
Результаты задания:
Создала Excel-книгу matrix.xls и в ней построила схему переходов глобального выравнивания
для следующих 2-х последовательностей:
1) Последовательность первых 4-х остатков моего белка - Cyns_ecoli.
2) Последовательность из 5 букв, полученную следующим образом: внесла в последовательность
первых 4-х остатков моего белка две любые замены и после третьего остатка вставила дополнительную букву.
Выделила оптимальный путь цветом. Таким образом, выравнивание имеет следующий вид:
MIQ-S
MDQKS
Вес выравнивания 3.
Параметры для построения схемы переходов:
вес совпадения = 2,
вес замены = -1,
штраф за гэп = -2.
Матрица переходов была заполнена построчно.
При построении в каждой ячейке указывала сначала направление обратного перехода,
а потом вес наилучшего пути, оканчивающегося в данной ячейке.
©Babskaya Evgeniya, 2005